Музей розташований у колишньому приміщенні Наукового Товариства Шевченка по вул. Володимира Винниченка 24 (2 поверх).
У музеї виставлено унікальні раритетні речі з археологічних експедицій Інституту, загалом експозиція налічує понад 3 тисячі цікавих та рідкісних експонатів.
Музей має шість просторих експозиційних залів, які охоплюють період від давньої кам'яної доби (палеоліту) до середньовіччя. Окремо представлена історія археології заходу України.